RACE實(shí)驗(yàn)深度探索:從原理到應(yīng)用的全面解析
來(lái)源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺(tái)
RACE實(shí)驗(yàn)深度探索總結(jié)普拉特澤生物技術(shù)為大家總結(jié)分享。本文是關(guān)于RACE實(shí)驗(yàn)的最后一篇介紹,前面我們學(xué)習(xí)了RACE實(shí)驗(yàn)提高擴(kuò)增特異性和效率的新方法、RACE實(shí)驗(yàn)與基因表達(dá)分析、探索RACE實(shí)驗(yàn)在疾病相關(guān)基因研究中的應(yīng)用價(jià)值,RACE實(shí)驗(yàn)有哪些發(fā)展趨勢(shì)?可以點(diǎn)擊標(biāo)題直接傳送回去學(xué)習(xí)的哦。普拉特澤生物工具檢測(cè)平臺(tái)承接RACE實(shí)驗(yàn)外包上百例~
早就為大家把實(shí)驗(yàn)過(guò)程中要踩的雷、吃的虧幫大家吃完了,現(xiàn)在我們就來(lái)看看RACE實(shí)驗(yàn)從原理到應(yīng)用的全面解析RACE,即cDNA末端快速擴(kuò)增技術(shù)(rapid amplification of cDNA ends),是一種基于逆轉(zhuǎn)錄PCR從樣本中快速擴(kuò)增cDNA的5′端及3′端的技術(shù)。
該技術(shù)由Frohman等人于1988年發(fā)明,為分子生物學(xué)研究提供了強(qiáng)有力的工具。
以下是對(duì)RACE實(shí)驗(yàn)從原理到應(yīng)用的全面解析
前期回顧:
RACE實(shí)驗(yàn)提高擴(kuò)增特異性和效率的新方法
探索RACE實(shí)驗(yàn)在疾病相關(guān)基因研究中的應(yīng)用價(jià)值
RACE實(shí)驗(yàn)有哪些發(fā)展趨勢(shì)
——RACE技術(shù)的原理
RACE技術(shù)的核心在于利用已知的部分cDNA序列,通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄和PCR擴(kuò)增,獲得完整的cDNA的5′和3′端序列。這一過(guò)程分為3′RACE和5′RACE兩部分。
?3′RACE?:
實(shí)驗(yàn)樣本通常為總RNA或poly(A)+RNA。
首先根據(jù)mRNA 3′末端天然存在的Poly(A)尾部設(shè)計(jì)反轉(zhuǎn)錄引物,逆轉(zhuǎn)錄獲得第一條cDNA鏈。
根據(jù)已知的cDNA序列設(shè)計(jì)基因特異性引物(GSP),合成第二條cDNA鏈。
隨后以GSP及正義鏈3′末端引物作為一對(duì)引物,對(duì)得到的cDNA鏈進(jìn)行PCR擴(kuò)增,從而得到cDNA的3′端序列。
?5′RACE?:
同樣以總RNA或poly(A)+RNA為實(shí)驗(yàn)樣本。
根據(jù)已知的cDNA序列設(shè)計(jì)GSP,逆轉(zhuǎn)錄獲得第一條cDNA鏈。
同時(shí)用末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶(TdT)在cDNA 3′端加Poly(C)尾。
依據(jù)Poly(C)尾設(shè)計(jì)特定引物合成第二條cDNA鏈。
隨后以第二條cDNA鏈為模板利用GSP合成雙鏈cDNA。
最后以GSP及反義鏈3′末端引物為一對(duì)引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,獲得cDNA 5′端序列。
——RACE技術(shù)的類(lèi)型及特點(diǎn)
隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,RACE技術(shù)也經(jīng)歷了多次改進(jìn),形成了多種類(lèi)型,包括經(jīng)典RACE、Adapter-Ligated RACE、RLM-RACE、Cap-switching RACE和環(huán)形RACE等。
?經(jīng)典RACE?:適用于擴(kuò)增有poly(A)尾結(jié)構(gòu)的RNA。
?Adapter-Ligated RACE?:利用T4連接酶將接頭與cDNA兩末端連接,使長(zhǎng)片段cDNA的克隆在擴(kuò)增反應(yīng)中占主導(dǎo)。
?RLM-RACE?:針對(duì)mRNA斷裂的可能進(jìn)行了技術(shù)優(yōu)化,通過(guò)切除斷裂mRNA 5′端暴露的磷酸基團(tuán)并連接接頭,實(shí)現(xiàn)完整mRNA 5′末端的擴(kuò)增。
?Cap-switching RACE?:適用于擴(kuò)增具有5′端帽子結(jié)構(gòu)的RNA,通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄酶在cDNA 3′端加上胞嘧啶殘基并引入接頭序列,實(shí)現(xiàn)5′端序列的擴(kuò)增。
?環(huán)形RACE?:利用T4連接酶將cDNA的末端連接形成環(huán)化結(jié)構(gòu)或串聯(lián)結(jié)構(gòu),通過(guò)設(shè)計(jì)特異性引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增
RACE實(shí)驗(yàn)在生物學(xué)研究中扮演著舉足輕重的角色,其應(yīng)用廣泛且深入。除了之前提到的克隆全長(zhǎng)cDNA、構(gòu)建cDNA文庫(kù)以及克隆已知片段的旁側(cè)內(nèi)部序列外,RACE實(shí)驗(yàn)還在以下領(lǐng)域發(fā)揮著重要作用:
?克隆同源基因的同源片段?:
在進(jìn)化生物學(xué)和比較基因組學(xué)的研究中,RACE實(shí)驗(yàn)?zāi)軌驇椭覀兛寺⊥椿虻耐雌?。通過(guò)比較不同物種中同源基因的序列差異,我們可以深入了解基因的進(jìn)化歷程和功能變化。
?獲得抗體可變區(qū)序列?:
在抗體工程中,RACE實(shí)驗(yàn)是一種重要的技術(shù)手段。通過(guò)RACE實(shí)驗(yàn),我們可以從B細(xì)胞中擴(kuò)增出抗體基因的可變區(qū)序列,進(jìn)而設(shè)計(jì)并優(yōu)化抗體,以滿(mǎn)足特定的診斷和治療需求。
?miRNA靶基因序列驗(yàn)證?:
miRNAs作為一類(lèi)重要的調(diào)控分子,在基因表達(dá)調(diào)控中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。RACE實(shí)驗(yàn)可以用于驗(yàn)證miRNA的靶基因序列,從而揭示miRNA在基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的具體作用機(jī)制。
?基因表達(dá)調(diào)控研究?:
RACE實(shí)驗(yàn)還可以用于研究基因表達(dá)的調(diào)控機(jī)制。通過(guò)比較不同條件下基因5′端和3′端序列的變化,我們可以了解啟動(dòng)子、增強(qiáng)子以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控元件對(duì)基因表達(dá)的影響。
——疾病相關(guān)基因的發(fā)現(xiàn)與研究?:
在疾病研究中,RACE實(shí)驗(yàn)有助于我們發(fā)現(xiàn)與疾病相關(guān)的基因。通過(guò)擴(kuò)增并克隆疾病相關(guān)基因的cDNA全長(zhǎng)序列,我們可以進(jìn)一步探索其在疾病發(fā)生和發(fā)展中的作用機(jī)制,為疾病的診斷和治療提供新的思路和方法。
綜上所述,RACE實(shí)驗(yàn)作為一種強(qiáng)大的分子生物學(xué)工具,在生物學(xué)研究中具有廣泛的應(yīng)用前景。通過(guò)不斷的技術(shù)改進(jìn)和創(chuàng)新,RACE實(shí)驗(yàn)將在更多領(lǐng)域發(fā)揮重要作用,推動(dòng)生物學(xué)研究的深入發(fā)展。
今天關(guān)于RACE實(shí)驗(yàn)從原理到應(yīng)用的全面解析就分享到這兒啦~如果您在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中遇到技術(shù)問(wèn)題,或者需要實(shí)驗(yàn)外包和代做,可與我們技術(shù)老師聯(lián)系18570028002(微信同號(hào))