什么是實時熒光定量PCR?
來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學整體課題外包平臺
大家好~今天跟大家一起學習的是實時熒光定量PCR實驗,普拉特澤生物跟大家一起從實驗的介紹、實驗步驟、操作注意事項、常見問題這四個方面跟大家一起學習,本篇及時實時熒光定量PCR的一個簡單介紹,一起來看吧!
實時熒光定量PCR (Quantitative Real-time PCR)是一種在DNA擴增反應中,以熒光化學物質(zhì)測每次聚合酶鏈式反應(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過內(nèi)參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進行定量分析的方法。Real-timePCR是在PCR擴增過程中,通過熒光信號對PCR進程進行實時檢測。由于在PCR擴增的指數(shù)時期,模板的Ct值和Log模板的起始拷貝數(shù)存在線性關系,所以成為定量的依據(jù)。
實時熒光定量PCR的原理是:在PCR反應體系中加入熒光基團,利用熒光信號積累實時監(jiān)測整個PCR進程,最后通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。將標記有熒光素的Taqman探針與模板DNA混合后,完成高溫變性,低溫復性,適溫延伸的熱循環(huán),并遵守聚合酶鏈反應規(guī)律,與模板DNA互補配對的Taqman探針被切斷,熒光素游離于反應體系中,在特定光激發(fā)下發(fā)出熒光,隨著循環(huán)次數(shù)的增加,被擴增的目的基因片段呈指數(shù)規(guī)律增長,通過實時檢測與之對應的隨擴增而變化熒光信號強度,求得Ct值,同時利用數(shù)個已知模板濃度的標準品作對照,即可得出待測標本目的基因的拷貝數(shù)。
實時熒光定量的檢測方法主要是分為兩種:SYBRGreenⅠ法和TaqMan探針法
1、SYBRGreenⅠ法:
在PCR反應體系中,加入過量SYBR熒光染料,SYBR熒光染料特異性地摻入DNA雙鏈后,發(fā)射熒光信號,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發(fā)射任何熒光信號,從而保證熒光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加完全同步。
SYBR定量PCR擴增熒光曲線圖
PCR產(chǎn)物熔解曲線圖(單一峰圖表明PCR擴增產(chǎn)物的單一性)
2、TaqMan探針法:
探針完整時,報告基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收;PCR擴增時,Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團和淬滅熒光基團分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物的形成完全同步。
那么實時熒光定量PCR在實際的生活中有哪些應用呢?
1、臨床疾病診斷
各型肝炎、艾滋病、禽流感、結(jié)核、性病等傳染病診斷和療效評價;地中海貧血、血友病、性別發(fā)育異常、智力低下綜合癥、胎兒畸形等優(yōu)生優(yōu)育檢測;腫瘤標志物及瘤基因檢測實現(xiàn)腫瘤病診斷;遺傳基因檢測實現(xiàn)遺傳病診斷。
2、動物疾病檢測
禽流感、新城疫、口蹄疫、豬瘟、沙門菌、大腸埃希菌、胸膜肺炎放線桿菌、寄生蟲病等、炭疽芽孢桿菌。
3、食品安全
食源微生物、食品過敏源、轉(zhuǎn)基因、乳品企業(yè)阪崎腸桿菌等檢測。
4、科學研究
醫(yī)學、農(nóng)牧、生物相關分子生物學定量研究。
好啦,那實時熒光定量PCR我們就簡簡單單的介紹到這里啦!下期跟大家分享實時熒光定量的PCR的操作步驟!如果您有實時熒光定量PCR實驗外包的需求的話歡迎留言,我們會及時回復的哦!