實(shí)時熒光定量PCR檢測步驟和注意事項(xiàng)【附視頻教程】
來源/作者:普拉特澤生物-醫(yī)學(xué)整體課題外包
一、實(shí)時熒光定量PCR的概念
什么是QPCR?實(shí)時熒光定量PCR檢測技術(shù)是指在PCR反應(yīng)體系中加入可與DNA產(chǎn)物異形結(jié)合的熒光基團(tuán),利用熒光信號積累監(jiān)測整個PCR過程,最終通過相對定量和絕對定量的方法確定各個樣本的表達(dá)量。
二、QPCR實(shí)驗(yàn)的應(yīng)用及分類
關(guān)于QPCR絕對定量和相對定量的應(yīng)用,絕對定量技術(shù)通常在病原體檢測、轉(zhuǎn)基因食品檢測以及基因表達(dá)研究中應(yīng)用比較廣泛;相對定量應(yīng)用于mRNA表達(dá)量分析、siRNA干擾效果的驗(yàn)證和基因過表達(dá)以及基因芯片效果的驗(yàn)證。
三、QPCR技術(shù)的兩大分類優(yōu)缺點(diǎn)對比
四、實(shí)時熒光定量PCR的實(shí)驗(yàn)步驟:
1、樣本制備;
2、RNA提取;
3、反轉(zhuǎn)錄;
4、QPCR引物設(shè)計及預(yù)實(shí)驗(yàn);
5、實(shí)時熒光定量QPCR數(shù)據(jù)分析。
五、QPCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)有哪些注意事項(xiàng)
1、擴(kuò)增曲線和熔解曲線
對于QPCR實(shí)驗(yàn)中涉及到的擴(kuò)增曲線和熔解曲線需要做如下的要求,由于擴(kuò)增曲線是反映PCR循環(huán)數(shù)與熒光強(qiáng)度的一條曲線,所以這條曲線要平滑完整,而熔解曲線是將溫度與熒光強(qiáng)度的變化求導(dǎo)得到是對數(shù)圖譜,所以要求熔解曲線是單一峰;
2、Ct值
同樣是QPCR實(shí)驗(yàn)中需要注意的重要參數(shù),它是PCR擴(kuò)增過程中,擴(kuò)增產(chǎn)物的熒光信號達(dá)到設(shè)定閾值時所經(jīng)過的擴(kuò)增循環(huán)次數(shù),也就是說,我們達(dá)到一個平臺期的時候,Ct值的起始value與平臺期之間存在一個Ct循環(huán)數(shù)的差異,我們稱之為該基因的擴(kuò)增倍數(shù)。經(jīng)過了多少個循環(huán)數(shù)達(dá)到平臺期所求出來的差值就是我們的Ct值。其特點(diǎn)是DNA模板量越多,達(dá)到熒光閾值的循環(huán)數(shù)越少,所以Ct值越小。
如圖所示,它的Ct value越偏向于右邊,它的起始模板量越少,越偏向于左邊,起始模板量越高。而它們最終都是要達(dá)到一個平臺期的。
3、反應(yīng)體系配置
配置體系時需要注意以下幾點(diǎn):
①SYBR MasterMix不要反復(fù)凍融;
②在一個管中配置Mix,減少加樣誤差;
③所有成分加完后,離心去除氣泡;
④每個樣品至少3-4個平行孔,方便進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析;
⑤需設(shè)置NTC陰性對照組,驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)材料是否具有污染。
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