QPCR檢測實驗詳細(xì)的步驟與報告(三)
來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺
前兩篇我們總結(jié)了QPCR檢測實驗詳細(xì)的操作步驟與結(jié)果報告,實驗?zāi)康亩际峭ㄟ^QPCR實驗技術(shù)定量檢測基因表達(dá)量。今天來學(xué)習(xí)QPCR檢測實驗詳細(xì)的步驟與報告的最后一篇,最后祝大家科研順利~
鏈接奉上,大家快點踩著普拉特澤的肩膀去摘蘋果吧!那現(xiàn)在我們來接著總結(jié):
一、實驗?zāi)康?/span>
通過QPCR實驗技術(shù)定量檢測基因表達(dá)量。
二、實驗樣品及分組
1.實驗樣本
備注:包括干預(yù)細(xì)胞用的相關(guān)試劑均按實驗樣品登記,每行登記一個或一組獨立樣品。
2.實驗分組
細(xì)胞: 293T
分組:OE-NC、OE-lnc BDNF-AS
指標(biāo): lncRNA BDNF-AS(NR_002832.2)
三、實驗結(jié)果
四、實驗材料
1.主要實驗儀器
2 主要實驗試劑及耗材
五、實驗原理
QPCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團,利用熒光信號累積實時監(jiān)測整個PCR進程,最后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進行定量分析的方法。根據(jù)熒光信號的變化能夠?qū)崟r檢測PCR擴增反應(yīng)中每一個循環(huán)擴增產(chǎn)物量的變化,通過Ct值和標(biāo)準(zhǔn)曲線的分析就能對起始模板進行定量分析。
六、實驗步驟
1.引物設(shè)計
2.樣品前期處理
向細(xì)胞樣本中加入500 μl Trizol。
3.RNA提取
(1) 向加有Trizol的1.5 ml EP管中加入100 μl氯仿,震蕩混勻后,靜置5 min,在12000 rpm,4度離心10 min。
(2) 從離心機中取出1.5 ml EP管,再將上層無色透明的水相層吸入到另一干凈的1.5 mlEP管中。(樣品會分為三層:下層有機相層,中間層和上層的水相層,RNA位于上層水相中。)加入等體積的異丙醇,上下輕輕顛倒混勻之后,靜置10 min,再12000 rpm,4度離心10 min。
(3) 離心之后可在EP管壁或管底看到膠狀沉淀出現(xiàn),沉淀就是要提取的RNA。小心棄去上清,不要將沉淀倒掉了。
(4) 用1 ml 75℅乙醇對RNA沉淀進行洗滌。然后于4℃ 7000 rpm離心5分鐘,將上清盡量去除干凈。
(5) 室溫靜置干燥,大約干燥5~10分鐘即可。(不要真空離心干燥,過于干燥會導(dǎo)致RNA的溶解性大大降低)。所有EP管中加入25 μl 的DEPC H2O,用槍頭吹打幾次,使RNA充分溶解,-80℃保存。
(6) RNA濃度檢測:使用核酸蛋白檢測儀檢測RNA濃度。
4.逆轉(zhuǎn)錄PCR
1. 按以下組份分別配制逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)液
2. cDNA立刻進行實驗或者置于4℃保存。
5.RNA濃度及純度測定:
(見實驗結(jié)果部分)
七、實時熒光定量PCR反應(yīng)
1. 反應(yīng)體系的配置
2.. 反應(yīng)條件設(shè)置:
擴增程序:
熔解程序:
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