EdU檢測(cè)實(shí)驗(yàn)操作步驟——及熒光定量分析數(shù)據(jù)
來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺(tái)
一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/span>
EdU檢測(cè)不同轉(zhuǎn)染處理對(duì)細(xì)胞增殖能力的影響。
二、實(shí)驗(yàn)樣品
2.1 實(shí)驗(yàn)樣本
備注:包括干預(yù)細(xì)胞用的相關(guān)試劑均按實(shí)驗(yàn)樣品登記,每行登記一個(gè)或一組獨(dú)立樣品。
2.2 實(shí)驗(yàn)參數(shù)
三、實(shí)驗(yàn)結(jié)果
圖1:EdU熒光檢測(cè)示例圖
圖2:熒光定量分析柱狀圖
四、實(shí)驗(yàn)結(jié)論
如圖所示,在CAL27細(xì)胞中,mimics NC和miR-23b-3p mimics組間無明顯差異,與inhibitorNC組相比,miR-23b-3p inhibitor組細(xì)胞增殖能力有所上調(diào);SCC25細(xì)胞各組間無明顯差異。
請(qǐng)注意:因無法獲知研究背景及研究方案,我司提交的結(jié)果說明僅針對(duì)該次檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行客觀描述,所下結(jié)論僅供參考。請(qǐng)合理判斷該檢測(cè)結(jié)果的可用性。
五、實(shí)驗(yàn)步驟
3.1 細(xì)胞復(fù)蘇 (如有)
(1)將ddH2O預(yù)溫至37℃。
(2)戴上手套和口罩帽子,從液氮罐中取出裝有目的細(xì)胞的凍存管(內(nèi)有1 mL細(xì)胞混合液),立即投入37℃ ddH2O中,輕搖凍存管使之在1分鐘內(nèi)快速溶解。
(3)完全溶解后,75%酒精擦拭凍存管外壁消毒后帶進(jìn)超凈臺(tái)。
(4)在超凈臺(tái)中,在15 mL滅菌離心管中預(yù)先加入10 mL新鮮配制的培養(yǎng)基,打開凍存管,將所有凍融的細(xì)胞懸液加入該離心管中,常溫1000 rpm離心3分鐘,吸除上層的培養(yǎng)液。
(5)1 mL培養(yǎng)基重懸細(xì)胞沉淀,輕輕吹打混勻后加入T25細(xì)胞培養(yǎng)瓶中,補(bǔ)足培養(yǎng)基至5 mL,置于37℃、5% CO2培養(yǎng)箱培養(yǎng)。
(6)48小時(shí)后換液,細(xì)胞融合接近80%時(shí)即可傳代。
3.2 細(xì)胞鋪板及轉(zhuǎn)染 (如有)
取處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,生長(zhǎng)狀態(tài)良好的293T細(xì)胞用0.25%胰酶消化后,通過細(xì)胞計(jì)數(shù)計(jì)算后,按照密度為4×104個(gè)細(xì)胞/孔,種到24孔板中,鋪細(xì)胞18-24 h (盡量不要超過24小時(shí),否則影響轉(zhuǎn)染效率),細(xì)胞長(zhǎng)至70~90%轉(zhuǎn)染(細(xì)胞密度過稀或者過密均會(huì)影響轉(zhuǎn)染效率),以24孔板為例:
(1) 將 1.6 μL LipoFiter /2 μL Lipo2000加入50 μLopti-mem Medium中,變成預(yù)混液1,室溫放置5 min。
(2) 將0.8 μg質(zhì)粒/20 pmol目的片段加入到50 μL opti-mem Medium中混合,變成預(yù)混液2。
(3) 將質(zhì)粒和 LipoFiter/Lipo2000混合(預(yù)混液1和預(yù)混液2進(jìn)行混合),室溫放置20分鐘。
(4) 將24孔板里的完全培養(yǎng)基換成150 μL opti-mem Medium。
(5) 將轉(zhuǎn)染混合液緩慢加入到24孔板,輕輕前后晃動(dòng)混勻。
(6) 37℃,5% CO2培養(yǎng)6 h后將培養(yǎng)基換成完全培養(yǎng)基。
3.3 EdU檢測(cè)實(shí)驗(yàn)步驟
EdU 標(biāo)記:
(1)用細(xì)胞完全培養(yǎng)基按比例稀釋EdU溶液,制備適量2×EdU 工作液,終濃度為50μM;
(2)每孔加入37°水浴的 EdU 工作液液500μL和500μL培養(yǎng)基(1比1),混合均勻后于培養(yǎng)箱孵育6-7小時(shí)(可根據(jù)細(xì)胞增殖速度,適當(dāng)調(diào)整孵育時(shí)間),使EdU終濃度為50 μM ;
(3)棄孵育培養(yǎng)基,PBS(含3%BSA,以下PBS表示)清洗細(xì)胞3次,每次5分鐘。
細(xì)胞固定及通透:
(1)每孔加入1 mL細(xì)胞固定液 (即含4%多聚甲醛的 PBS)室溫孵育15分鐘,棄固定液;
(2)每孔加入PBS,清洗3次,每次5分鐘;
(3)每孔加入1 mL滲透劑(0.3% TritonX-100的PBS)室溫孵育15分鐘;PBS清洗3次,每次5分鐘
EdU檢測(cè):
(1)每孔加入0.2 ml Click反應(yīng)混合液,輕輕搖晃培養(yǎng)板以確保反應(yīng)混合物可以均勻覆蓋樣品,體系按需配置;避光反應(yīng)1-2小時(shí);
(2)吸除Click反應(yīng)液,用洗滌液洗滌3次,每次3-5分鐘;
DNA 染色:
(1) DAPI溶液的配制:按1:1000比例用PBS稀釋DAPI (1000X),避光保存;
(2) 每孔加1X DAPI溶液1ml,室溫避光孵育10分鐘左右;
(3)每孔加入PBS 清洗 1~3 次;
(4)采圖。
五、熒光定量分析數(shù)據(jù)
注:組化定量分析采用image pro plus 6.0軟件,IOD值為圖片上各點(diǎn)光密度值的累加,此值與目標(biāo)物質(zhì)的總量成正比;IOD值除以目標(biāo)分布區(qū)域的面積,得到平均density,此值反映了目標(biāo)物質(zhì)的單位面積濃度。對(duì)樣品照片進(jìn)行數(shù)字圖像分析比較時(shí),就是比較他們之間的平均光密度值的大小。
單位為a.u.(arbitrary unit),是無量綱單位
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