什么是實(shí)時熒光定量PCR?
來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺
大家好~今天跟大家一起學(xué)習(xí)的是實(shí)時熒光定量PCR實(shí)驗(yàn),普拉特澤生物跟大家一起從實(shí)驗(yàn)的介紹、實(shí)驗(yàn)步驟、操作注意事項(xiàng)、常見問題這四個方面跟大家一起學(xué)習(xí),本篇及時實(shí)時熒光定量PCR的一個簡單介紹,一起來看吧!
實(shí)時熒光定量PCR (Quantitative Real-time PCR)是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,以熒光化學(xué)物質(zhì)測每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過內(nèi)參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進(jìn)行定量分析的方法。Real-timePCR是在PCR擴(kuò)增過程中,通過熒光信號對PCR進(jìn)程進(jìn)行實(shí)時檢測。由于在PCR擴(kuò)增的指數(shù)時期,模板的Ct值和Log模板的起始拷貝數(shù)存在線性關(guān)系,所以成為定量的依據(jù)。
實(shí)時熒光定量PCR的原理是:在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號積累實(shí)時監(jiān)測整個PCR進(jìn)程,最后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。將標(biāo)記有熒光素的Taqman探針與模板DNA混合后,完成高溫變性,低溫復(fù)性,適溫延伸的熱循環(huán),并遵守聚合酶鏈反應(yīng)規(guī)律,與模板DNA互補(bǔ)配對的Taqman探針被切斷,熒光素游離于反應(yīng)體系中,在特定光激發(fā)下發(fā)出熒光,隨著循環(huán)次數(shù)的增加,被擴(kuò)增的目的基因片段呈指數(shù)規(guī)律增長,通過實(shí)時檢測與之對應(yīng)的隨擴(kuò)增而變化熒光信號強(qiáng)度,求得Ct值,同時利用數(shù)個已知模板濃度的標(biāo)準(zhǔn)品作對照,即可得出待測標(biāo)本目的基因的拷貝數(shù)。
實(shí)時熒光定量的檢測方法主要是分為兩種:SYBRGreenⅠ法和TaqMan探針法
1、SYBRGreenⅠ法:
在PCR反應(yīng)體系中,加入過量SYBR熒光染料,SYBR熒光染料特異性地?fù)饺?/span>DNA雙鏈后,發(fā)射熒光信號,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發(fā)射任何熒光信號,從而保證熒光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加完全同步。
SYBR定量PCR擴(kuò)增熒光曲線圖
PCR產(chǎn)物熔解曲線圖(單一峰圖表明PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的單一性)
2、TaqMan探針法:
探針完整時,報告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號被淬滅基團(tuán)吸收;PCR擴(kuò)增時,Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使報告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實(shí)現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物的形成完全同步。
那么實(shí)時熒光定量PCR在實(shí)際的生活中有哪些應(yīng)用呢?
1、臨床疾病診斷
各型肝炎、艾滋病、禽流感、結(jié)核、性病等傳染病診斷和療效評價;地中海貧血、血友病、性別發(fā)育異常、智力低下綜合癥、胎兒畸形等優(yōu)生優(yōu)育檢測;腫瘤標(biāo)志物及瘤基因檢測實(shí)現(xiàn)腫瘤病診斷;遺傳基因檢測實(shí)現(xiàn)遺傳病診斷。
2、動物疾病檢測
禽流感、新城疫、口蹄疫、豬瘟、沙門菌、大腸埃希菌、胸膜肺炎放線桿菌、寄生蟲病等、炭疽芽孢桿菌。
3、食品安全
食源微生物、食品過敏源、轉(zhuǎn)基因、乳品企業(yè)阪崎腸桿菌等檢測。
4、科學(xué)研究
醫(yī)學(xué)、農(nóng)牧、生物相關(guān)分子生物學(xué)定量研究。
好啦,那實(shí)時熒光定量PCR我們就簡簡單單的介紹到這里啦!下期跟大家分享實(shí)時熒光定量的PCR的操作步驟!如果您有實(shí)時熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)外包的需求的話歡迎留言,我們會及時回復(fù)的哦!