血管生成實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析教程——細(xì)胞實(shí)驗(yàn)外包
來源/作者:普拉特澤-生物醫(yī)學(xué)整體課題外包平臺(tái)
血管形成實(shí)驗(yàn)結(jié)果數(shù)據(jù)分析由普拉特澤生物給大家總結(jié)分享。血管形成實(shí)驗(yàn)在腫瘤醫(yī)學(xué)的研究與治療中一直是實(shí)驗(yàn)熱點(diǎn),我們的細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)也承接了上百例血管生成實(shí)驗(yàn)代做服務(wù),血管生成是一個(gè)極其復(fù)雜的過程,包括血管內(nèi)皮細(xì)胞基質(zhì)的降解、內(nèi)皮細(xì)胞移行、增殖、管道分化等各種步驟。今天咱們就來看看已經(jīng)成功形成了血管的實(shí)驗(yàn)結(jié)果應(yīng)該有哪些量化指標(biāo)與分析步驟吧!
我們常用的量化指標(biāo)有:number of tubes; number of loops/meshes; number of branch sites/nodes; length of tubes。文獻(xiàn)中常用的分析指標(biāo)是branch points與capillary length:
現(xiàn)在我們來看看使用ImageJ插件Angiogenesis Analyzer對血管網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行定量的詳細(xì)步驟!
詳細(xì)步驟:1、ImageJ軟件File -> Open打開待分析圖片:
也可通過點(diǎn)擊Angiogenesis Analyzer插件,下載示例圖片:
下載完成后示例圖片會(huì)保存在文件夾中:
2. 打開Angiogenesis Analyzer文本文件,即可見Angiogenesis Analyzer分析界面:
點(diǎn)擊扳手形狀選擇Settings可設(shè)置測量參數(shù):
點(diǎn)擊Network analysis分析界面,Angiogenesis Analyzer插件可以分析小管形成明場圖片(Phase Contrast)或熒光圖片(Fluo):
本圖片為明場圖片,點(diǎn)擊Analyze HUVEC Phase Contrast,等待分析完成后即可得到分析結(jié)果:
3. File -> Save as…即可保存結(jié)果到Excel表格,Angiogenesis Analyzer插件可以得到如下諸多結(jié)果:
4. Angiogenesis Analyzer插件Analyze Binary Tree也可以分析二值化的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)(如神經(jīng)元、血管等):
參考文獻(xiàn):
1. DeCicco-Skinner KL, Henry GH, Cataisson C, et al. Endothelial cell tube formation assay for the in vitro study of angiogenesis. J Vis Exp. 2014
2. Carpentier, G. ImageJ contribution: Angiogenesis Analyzer. ImageJ News. 2012
3. Wüstehube J, Bartol A, Liebler SS, et al. Cerebral cavernous malformation protein CCM1 inhibits sprouting angiogenesis by activating DELTA-NOTCH signaling. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010;107(28):12640-5
好啦,那今天給大家分享的血管形成實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析就到此為止了,希望能給到大家實(shí)驗(yàn)操過程中的一定的幫助,如果您有血管生成實(shí)驗(yàn)外包的需求,歡迎隨時(shí)留言哦!我們下期見~